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IMRB > Plateformes > Plateforme génomique


Présentation de la plateforme génomique

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Présentation

Deux services sont disponibles sur cette plateforme génomique :

-Service commun de séquençage
Plateforme séquençage
 Situé au rez-de-chaussée de l'hôpital Henri Mondor et ouvert entre 9h et 17h30 du lundi au vendredi.  Son fonctionnement est sous la responsabilité de Bruno Costes.
Ce service vise à répondre aux besoins en séquences et en analyses de fragments des unités et équipes de recherche de l'IMRB, et plus généralement de l'UPVM (Université Paris Val de Marne).

 Charte d'utilisation de la plateforme de séquençage (en cours)
 Protocole de séquençage (en cours)
 Feuille de demande de séquençage (en cours)
 Equipements de la plateforme de séquençage (en cours)

-Plateforme de puces à ADN
Plateforme Microarrays
 Cette plateforme est à disposition sur le site au 1er sous-sol du bâtiment de l'hôpital Henri Mondor. Ell est dédiée à la détection de remaniements chromosomiques via la technologie de CGHarray (Comparative Genomic Hybridization).
Le bon fonctionnement de ce service est sous la responsabilité de Laure Lecerf.

  Charte d'utilisation de la plateforme puces à ADN
  Formulaire de demande de prestations

Equipement :
Scanner Agilent Technologies, date d’installation : septembre 2005. Juillet 2010 : mise à niveau du scanner pour une résolution de 2µm
Station d’hybridation Tecan, date d’installation : novembre 2008
BioAnalyzer 2100 (Agilent Technologies), date d’installation : novembre 2008
Etuve d’hybridation Agilent, date d’installation : juin 2007
Spectrophotomètre Nanodrop (Nyxor biotech), date d’installation : septembre 2004
Thermocycleurs Eppendorf, date d’installation : octobre 2005
Thermocycleurs Biometra TGradient, date d’installation : janvier 2004
Robot spotteur Qarray (Genetix), date d’installation : 2001
Robot MultiPROBE II (Packard Instrument), date d’installation : 2001

Contacts



Coordonnateur
Michel Goossens,
01 49 81 28 61



Plateforme de séquençage
Responsable technique

Bruno Costes,
01 49 81 35 85


Plateforme puces à ADN
Responsable technique

Laure Lecerf,
01 49 81 35 62


Personnels plateforme Séquençage et Génotypage :

Natacha Martin,  Hélène Migot

Personnels plateforme Puces à ADN :
Valérie Ortonne, Valérie Delattre, Wilfried Verbecq-Morlot, Audrey Briand, Corinne Metay,

Publications

L. Tosca, S. Brisset, F. Petit, L. Lecerf, ML. Maurin, G. Rousseau, C. Bas, M. Laroudie, S. Tapia, O. Picone, S. Prevot, M. Goossens, P. Labrune and  G. Tachdjian.  Recurrent fetal interstitial 70Mb duplication 4q22.2q32.2 due to ovarian germinal mosaicism. European Journal of Human Genetics, 2010, vol 18 (8), 882-88

E. Katzaki, G. Morin, M. Pollazzon, F. Tiziana Papa, S.Buoni, G. Hayek, J. Andrieux, L. Lecerf, C. Popovici, A. Receveur, M. Mathieu-Dramard, A. Renieri, F. Mari, N. Philip. Syndromic Mental Retardation with Thrombocytopenia due to 21q22.11q22.12: report of three patients. American Journal of Medical Genetics, 2010, vol 152A (7), 1711-17

I. Mannelli, L. Lecerf, M. Gerrouache, M. Goossens, M-C Millot and M. Canva. DNA immobilisation procedures for surface plasmon resonance imaging (SPR) based microarray systems. Biosensors and Bioelectronics, 2007, 22 : 803-809


mise à jour le 5 janvier 2012

Université Paris-Est Créteil Val de Marne (UPEC) Université Paris-Est

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