Ce pôle, localisé au sein des hôpitaux Henri Mondor et Albert Chenevier de Créteil, est composé de sept équipes dont l'outil principal d'investigation est l'analyse de l'expression des génomes. Ces équipes développent trois axes de recherche spécifiques bénéficiant de plateformes communes.

 L'axe de recherche en "Virologie Moléculaire et Immunologie" est animé par deux équipes qui mènent une recherche en virologie, immunologie et vaccinologie sur les virus d'hépatites (Pr JM Pawlotsky) et le VIH (Pr Y. Levy). Elles visent à comprendre les mécanismes des pathologies développées par les tissus cibles (lymphocytes, hépatocytes) lors des agressions virales, étudier les mécanismes moléculaires de la réponse aux traitements anti-viraux et de la résistance aux nouvelles drogues, développer de nouvelles approches thérapeutiques et vaccinales. Ces équipes disposent de la plateforme génomique, d'une plateforme de virologie moléculaire, d'une plateforme d'immunomonitoring, et prochainement d'un laboraroire de type L3. Elles sont les structures fondatrices du laboratoire d'excellence "Vaccinal Research Institute" récemment créé sous l'impulsion du Pr Y. Levy.

Un axe "Oncologie" est dédié notamment aux cancers urologiques (Pr A. de la Taille) et les lymphomes (Pr P. Gaulard). Ces deux équipes recherchent de nouveaux marqueurs pour l'aide au diagnostic, au pronostic et au suivi des patients, et visent à comprendre les mécanismes physiopathologiques impliqués dans ces affections. Ces deux équipes partagent des approches expérimentales communes et bénéficient de la plateforme génomique pour la caractérisation de l'expression des gènes. L'équipe Lymphome tire également parti de la mise en place d'une plateforme sur l'étude des lymphomes (Gela-P) pour la validation du diagnostic, la recherche de marqueurs prédictifs de réponse à de nouveaux schémas thérapeutiques.

L'axe "Maladies Génétiques" réunit trois équipes qui étudient les gènes dont l'expression est altérée au cours du développement (neurocristopathies), la mucoviscidose et les hémoglobinopathies (Pr M. Goossens), dans différentes pathologies psychiatriques (troubles bipolaires, schizophrénie, autisme, trouble obsessionel compulsif) (Pr M. Leboyer), et les syndromes néphrotiques (Dr D. Sahali). Ces équipes s'appuient sur d'importantes cohortes de patients et gèrent la plate-forme génomique mise à la disposition des autres équipes de l'IMRB.
L'équipe psychiatrie du Pr M. Leboyer coordonne le RTRS Santé Mentale (Fondation FondaMental), le Dr D. Sahali est responsable du Centre de référence maladies rares pour le syndrome néphrotique idiopathique et l'équipe du Pr M. Goossens a en charge le Centre de référence national pour le diagnostic des maladies génétiques.

Ces sept équipes regroupent les expertises pour l'étude des gènes (humains ou viraux), ainsi que pour les analyses génomiques et protéomiques nécessaires à la dissection des  processus pathologiques et au développement d'approches diagnostiques et thérapeutiques ciblées.